Enzimatik Bakış

Yazarlar

Birnur Akkaya
Recep Akkaya

Özet

"Güncel Biyokimya Çalışmaları II" kitabında yer alan ve Birnur Akkaya ile Recep Akkaya tarafından kaleme alınan "Enzimatik Bakış" başlıklı bu bölüm, canlıların temel biyolojik katalizörleri olan enzimlerin tanımını, tarihsel gelişimini, yapısını ve kataliz mekanizmalarını kapsamlı biçimde incelemektedir. Metinde, enzim adlandırma standartları, E.C. kodlama sistemi ve Uluslararası Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Derneği tarafından tanımlanan altı temel enzim sınıfı (oksidoredüktazlar, transferazlar, hidrolazlar, liyazlar, izomerazlar ve ligazlar) ayrıntılı olarak tanıtılmaktadır. Enzimleri kimyasal katalizörlerden ayıran yüksek etkinlik, özgüllük, ılımlı hücresel koşullarda çalışabilme, çevreyi kirletmeme ve metabolik düzenlenebilirlik gibi üstün nitelikler açıklanmaktadır. Protein yapısındaki apoenzimlerin yanı sıra esansiyel iyonlar ve koenzimler gibi kofaktörlerin rolleri incelenmekte; aktif merkezin substrat ve geçiş hali etkileşimleri Kilit-Anahtar, İndüklenmiş Uyum ve Üç Noktadan Bağlanma modelleri çerçevesinde değerlendirilmektedir. Tepkimelerin aktifleşme enerjisinin düşürülmesi, entropinin azaltılması ve substrat yönlenmesinin yanı sıra çözücü-substrat yer değiştirme, asit-baz, metal iyonu, elektrostatik ve kovalan kataliz gibi aktif merkezde yürütülen temel moleküler mekanizmalar detaylandırılmaktadır. Bununla birlikte üreaz, laktat dehidrogenaz ve triozfosfat izomeraz gibi spesifik örneklerle teorik anlatım desteklenmektedir. Biyokimya ve moleküler biyoloji alanındaki araştırmacılar ile öğrenciler için hazırlanan bu bölüm, biyolojik katalizin temel prensiplerine dair yetkin, anlaşılır ve bütüncül bir rehber niteliği taşımaktadır.

Referanslar

Faber, K. (2014) Biotransformations in Organic Chemistry, A Textbook, Springer Verlag, 6th Ed.

Nelson, D.L. ve Cox, M.M. (2008) Enzymes. Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed.

Voet, D. ve Voet, J. G.(2011) Biochemistry, New York, John Wiley and Sons, 4th Ed.

Keha, E.E. ve Küfrevioğlu, Ö.İ. (2012) Biyokimya, Aktif Yayınevi, 9.Baskı.

Roskoski, R. (1996) Biochemistry. W.B. Saunders Company, 1st Ed.

Bisswanger, H. (2008) Enzyme Kinetics, Principles and Methods. Wiley-VCH Verlag. 2nd Ed.

Murray, R.K., Granner, D.K., Mayes, P.A. ve Rodwell, V.W. (2003). Enzyme: Mechanism of Action. Harper’s Illustrated Biochemistry. 26th Ed

Yayınlanan

4 Ekim 2021

Lisans

Lisans